MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 6453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015850	GCC	2	6	954287	954292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2002	NC_015850	GAA	2	6	955690	955695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_015850	AGC	2	6	957923	957928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_015850	GGC	2	6	958697	958702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_015850	CCT	2	6	961362	961367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2006	NC_015850	TGA	2	6	961374	961379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_015850	ATA	2	6	962184	962189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_015850	GTTA	2	8	962199	962206	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_015850	ATGGA	2	10	962221	962230	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_015850	GACC	2	8	962467	962474	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2011	NC_015850	TCGG	2	8	962477	962484	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2012	NC_015850	GA	3	6	966976	966981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_015850	T	6	6	966996	967001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_015850	CG	3	6	967006	967011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2015	NC_015850	GCG	2	6	967021	967026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2016	NC_015850	TCC	3	9	967089	967097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2017	NC_015850	CCA	2	6	967101	967106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2018	NC_015850	T	6	6	967141	967146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_015850	CGCGC	2	10	967160	967169	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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2021	NC_015850	TCG	2	6	967212	967217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2022	NC_015850	TCC	2	6	967253	967258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2023	NC_015850	ACC	2	6	969496	969501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2024	NC_015850	ATT	2	6	970992	970997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_015850	CGACT	2	10	972553	972562	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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2036	NC_015850	CCGCT	2	10	978046	978055	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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2043	NC_015850	GTGG	2	8	979142	979149	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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2050	NC_015850	TGG	2	6	980595	980600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2052	NC_015850	GCG	2	6	980634	980639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2053	NC_015850	CGC	2	6	980671	980676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2054	NC_015850	GCG	2	6	980697	980702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2055	NC_015850	GTG	2	6	980778	980783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2056	NC_015850	TGG	2	6	980795	980800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2061	NC_015850	CCCG	2	8	981180	981187	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2062	NC_015850	CGA	2	6	981212	981217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2063	NC_015850	TGC	2	6	981418	981423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2064	NC_015850	GAC	2	6	983517	983522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2065	NC_015850	GCA	3	9	983577	983585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2066	NC_015850	CCA	2	6	983586	983591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2067	NC_015850	ACG	2	6	983595	983600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2068	NC_015850	AT	3	6	984095	984100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2073	NC_015850	TCC	2	6	992100	992105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2078	NC_015850	GA	3	6	996813	996818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2093	NC_015850	AT	3	6	1012217	1012222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2094	NC_015850	TG	3	6	1012226	1012231	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2095	NC_015850	CTT	2	6	1012268	1012273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2097	NC_015850	CTT	2	6	1012298	1012303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2098	NC_015850	CTG	3	9	1012304	1012312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2099	NC_015850	GCG	2	6	1012352	1012357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2103	NC_015850	GTT	2	6	1012529	1012534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2104	NC_015850	GCT	2	6	1012547	1012552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2105	NC_015850	CTC	2	6	1013866	1013871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2106	NC_015850	GTGG	2	8	1016150	1016157	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2107	NC_015850	TAC	2	6	1016158	1016163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2109	NC_015850	CCG	3	9	1019377	1019385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2110	NC_015850	CCT	2	6	1019992	1019997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2111	NC_015850	CGG	2	6	1020025	1020030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2112	NC_015850	CT	3	6	1020090	1020095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2113	NC_015850	TTC	2	6	1020146	1020151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2116	NC_015850	TCG	2	6	1020229	1020234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2117	NC_015850	GTT	3	9	1020235	1020243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_015850	TGC	2	6	1020294	1020299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2119	NC_015850	CGC	2	6	1020336	1020341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2121	NC_015850	GAA	2	6	1021684	1021689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2122	NC_015850	AAC	2	6	1026129	1026134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2123	NC_015850	CGGC	2	8	1026154	1026161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2124	NC_015850	GGC	2	6	1026206	1026211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2125	NC_015850	GGAG	2	8	1026280	1026287	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2126	NC_015850	GCG	2	6	1026346	1026351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2127	NC_015850	GGT	2	6	1026385	1026390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2128	NC_015850	T	6	6	1026427	1026432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2129	NC_015850	CAC	2	6	1026440	1026445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2130	NC_015850	GCG	3	9	1026459	1026467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2131	NC_015850	TTCT	2	8	1026564	1026571	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2133	NC_015850	ACAGTC	2	12	1026634	1026645	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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